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ISATAP和6to4都是目前比较流行的自动建立隧道的过渡技术，都可以连接被IPv4隔绝的IPv6孤岛，都是通过将IPv4地址嵌入到 IPv6地址当中，并将IPv6封包封装在IPv4中传送，在主机相互通信中抽出IPv4地址建立tunnel。但具体实现的流程，IPv6地址和应用范围不尽相同。
ISATAP(draft-ietf-ngtrans-isatap-23.txt) 的全名是 Intra-Site Automatic Tunnel Addressing Protocol，它将IPv4地址夹入IPv6地址中，当两台 ISATAP 主机通讯时，可自动抽取出 IPv4 地址建立 Tunnel 即可通讯，且并不需透过其它特殊网络设备，只要彼此间IPv4网络通畅即可。
双栈主机支持isatap后会自动在该隧道接口上生成本地链路的前缀(fe80::开头)和64位的接口标识符::0:5EFE:X.X.X.X(这里的X.X.X.X是双栈主机的IPv4单播地址)，这样就可以和同一子网内其他isatap客户机进行ipv6 通讯了；如果需要和其他网络的isatap客户机或者IPv6网络通信，必须通过ISATAP路由器拿到全球单播地址前缀(2001:, 2002:, 3ffe:开头)，通过路由器与其他IPv6主机和网络通信。
ISATAP过渡技术不要求隧道端节点必须具有全球惟一的IPv4地址，只要双栈主机具有IPv4单播地址即可，不管该地址公有的还是私有的都可以。
6to4(RFC3056)机制被定义在站点之间进行IPv6通讯，每个站点必须至少有一台“6to4”路由器作为出入口，使用特需的地址格式，地址前缀为(2002:开头)，并将路由器的IPv4地址夹入IPv6地址中，因此位于不同6to4 site内的主机彼此通讯时即可自动抽出IPv4地址在路由器之间建立Tunnel。
透过6to4 router，不同6to4 site内的主机可互相通讯，当需与一般IPv6主机通讯时，则必须过6to4 relay router。6to4 relay router必须同时具备6to4及IPv6接口，同时提供这些接口的封包转送。
6to4需要一个全球合法的IPv4地址，所以对解决IPv4地址短缺没有太大帮助。但它不需要申请IPv6地址，通过它可使站点迅速升级到 IPv6。